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1930年，享有盛名的中央研究院植物研究所与北平研究院植物研究所先后成立，分别由秦仁昌、刘慎锷负责。前者1934年后在罗宗洛主持下，扩充内容，相继设立分类学，生理学、藻类学、真菌学、形态学等研究室，使得研究范围逐渐向纵深扩展。后者则主要从事对我国西北部与北部植物的研究。
此外，比较有名的研究机构还有中央研究院自然历史博物馆与西部科学院，前者主要进行分类学、寄生者及海洋生物调查研究，后者则由中国科学社于1930年在重庆北碚创建，是我国西部最早设立的一个生物研究机构。
随着各方面专项研究的进展和研究队伍的壮大，1933年，中国植物学会在重庆北碚召开了成立大会，其专刊《中国植物学会杂志》每年出版1卷，每卷4期，同时还发行不定期的英文刊物，向国外植物学界介绍我国的研究成果，以增进交流，扩大影响。两年后，中国动物学会也于北平宣告成立，至抗战前夕，会员已达100余名。